Тоннель судопропускного сооружения С-1 является объектом транспортной инфраструктуры. Для обеспечения безопасности задействовано 52 автоматические системы. Диспетчерская служба постоянно контролирует обстановку в тоннеле и в случае возникновения аварийных и чрезвычайных ситуаций экстренно принимает все необходимые меры для обеспечения безопасности водителей и пассажиров движущегося по тоннелю автотранспорта. 12 июля 2020 года в 15.05 часов в Невском транспортном отсеке автодорожного тоннеля КЗС был обнаружен посторонний предмет. В соответствии с регламентом реагирования на подобные ситуации было полностью остановлено движение в тоннеле. Для обследования потенциально опасного постороннего предмета оперативно вызваны службы быстрого реагирования МВД и ФСБ РФ по Северо-западному региону. В 15.40 подозрительный предмет был удален с проезжей части. Дирекция КЗС приносит извинения за доставленные неудобства всем водителям и их пассажирам потерявшим время в ожидании открытия движения. Все действия ответственных лиц были выполнены в точном соответствии с регламентом по предотвращению террористических угроз объектам транспортной инфраструктуры.